摘要：目的從一株深海放線菌S.koyangensisSCSIO5802中分析鑒定多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素candicidin的生物合成基因簇,并推導(dǎo)其生物合成途徑。方法①利用PCR-targeting方法對(duì)負(fù)責(zé)abyssomicin類化合物的聚酮合酶abmB1進(jìn)行同框缺失,并利用HPLC-MS對(duì)獲得的突變株SCSIO5802A代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析以鑒定其它新型化合物;②利用生物信息學(xué)方法對(duì)S.koyangensisSCSIO5802的全基因組序列進(jìn)行注釋分析,以尋找candicidin的生物合成基因簇;③結(jié)合candicidin結(jié)構(gòu)特征、基因簇內(nèi)生物合成基因的功能以及I型聚酮化合物的生物合成原理,對(duì)其生物合成途徑進(jìn)行推導(dǎo);④利用阿普拉抗性基因片段對(duì)candicidin生物合成基因簇中的聚酮合酶基因canD進(jìn)行替換突變,以確定基因簇的正確性。結(jié)果abmB1基因的同框缺失突變株SCSIO5802A不生產(chǎn)abyssomicins類化合物,從該突變株中鑒定了一類之前未發(fā)現(xiàn)的多烯大環(huán)內(nèi)酯類化合物candicidins;利用生物信息學(xué)鑒定了candicidin生物合成基因簇,并對(duì)其生物合成途徑進(jìn)行了推導(dǎo);對(duì)聚酮合酶基因canD進(jìn)行抗性替換突變獲得的突變株SCSIO5802AC不生產(chǎn)candicidins類化合物,確認(rèn)了該基因簇的正確性。結(jié)論本研究將為利用組合生物合成的方法獲得candicidin新結(jié)構(gòu)衍生物以及基于基因組信息的新型天然產(chǎn)物挖掘奠定了基礎(chǔ)。