摘要:龍腦香科植物是東南亞地區(qū)重要的熱帶木材來(lái)源樹(shù)種,對(duì)其開(kāi)展DNA條形碼評(píng)估在林業(yè)監(jiān)管及森林資源保護(hù)等方面具有非常重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。通過(guò)對(duì)龍腦香科植物樣品進(jìn)行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四個(gè)片段的擴(kuò)增和測(cè)序,結(jié)合GenBank下載的數(shù)據(jù),共獲得龍腦香科樹(shù)種14屬244種共計(jì)899條序列。通過(guò)比較4個(gè)片段的通用性、序列特征、種內(nèi)和種間的遺傳變異,基于Best Match (BM)、Best Close Match (BCM)、相似性搜索算法(BLAST)和鄰接樹(shù)(NJ) 4種方法評(píng)估DNA條形碼對(duì)于龍腦香科樹(shù)種的鑒定能力。結(jié)果表明, ITS2在龍腦香科樹(shù)種中鑒定效率最高,通過(guò)優(yōu)化的擴(kuò)增體系能夠從該科植物葉片中獲得較高質(zhì)量的ITS2片段;葉綠體matK片段擴(kuò)增和測(cè)序效率為100%,且種內(nèi)及種間遺傳變異明顯,鑒定成功率高于其它葉綠體片段,并據(jù)此提出ITS2和matK適合作為龍腦香科樹(shù)種的DNA條形碼。
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