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采用SNaPshot技術(shù)對蘇南地區(qū)耳聾患者進行基因突變熱點篩查

摘要:目的明確蘇南地區(qū)非綜合征型耳聾患者7個耳聾致病基因突變熱點的突變頻率,驗證中國人群耳聾遺傳病因篩查的SNaPshot技術(shù)平臺的效能。方法以125例非綜合征型耳聾(non—syndromic hearing loss,NSHL)患者為研究對象,應(yīng)用SNaPshot技術(shù),針對GJB2基因235delC和299—300delAT,SLC26A4基因IVS7—2A〉G和2168A〉G,線粒體DNA(mtDNA)1555A〉G、7445A〉G和3243A〉G共7個突變熱點在一個反應(yīng)管中進行多重PCR后,單堿基熒光延伸標記,再采用ABI3130遺傳分析儀行毛細管電泳進行基因分型,并利用直接測序和聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法驗證基因分型結(jié)果。結(jié)果(1)125例樣本中,GJB2基因235delC突變頻率為24.0%,299-300delAT突變頻率為5.6%;SLC26A4基因IVS7—2A〉G突變頻率為15.2%,2168A〉G突變頻率為3.2%;線粒體DNA1555A〉G突變頻率為4.8%,7445A〉G突變頻率為0.8%,未發(fā)現(xiàn)線粒體DNA3243A〉G位點突變,7個熱點綜合突變頻率為53.6%。(2)SNaPshot結(jié)果與直接測序或PCR—RFLP結(jié)果完全吻合,檢測的特異性和敏感性均為100%。結(jié)論(1)蘇南地區(qū)耳聾患者7個位點突變頻率超過半數(shù);(2)用SNaPshot技術(shù)篩查耳聾基因,在一個反應(yīng)管中同時檢測到了7個突變熱點,其檢測效能高,具有臨床應(yīng)用價值。

關(guān)鍵詞:
  • 非綜合征型耳聾  
  • 基因篩查  
  • gjb2基因  
  • slc26a4基因  
  • 線粒體dna  
  • snapshot技術(shù)  
作者:
李紅; 李海波; 毛君; 劉敏娟; 程洪波; 李士林; 陳瑛
單位:
南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院生殖與遺傳中心; 蘇州215002; 復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)院
刊名:
中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)

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