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基于貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法的多重液相色譜-質(zhì)譜試驗(yàn)數(shù)據(jù)匹配研究

摘要:液相色譜-質(zhì)譜試驗(yàn)在多肽分子質(zhì)量測定、肽序列測定、蛋白質(zhì)組成等方面應(yīng)用廣泛。蛋白質(zhì)樣本經(jīng)過與酶的反應(yīng),斷開成肽鏈。通過液相色譜-質(zhì)譜儀,形成三維肽信號譜圖。為減小試驗(yàn)誤差,部分試驗(yàn)采取同種樣本多次重復(fù)試驗(yàn)。但是,由于干擾因素的存在,導(dǎo)致多重試驗(yàn)的譜圖在時間軸出現(xiàn)偏差的現(xiàn)象。選取MS/MS試驗(yàn)表中檢測到的肽信號作為訓(xùn)練序列,在Warping函數(shù)基礎(chǔ)上,通過貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法對多重譜數(shù)據(jù)時間進(jìn)行校準(zhǔn)。結(jié)果表明,用Warping的測試結(jié)果準(zhǔn)確性均值為86.81%,聯(lián)合使用貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法建模準(zhǔn)確率均值達(dá)到93.08%。同時,對兩個譜圖進(jìn)行全集校準(zhǔn),覆蓋率超過89%,為下一步進(jìn)行蛋白質(zhì)量化提供數(shù)據(jù)支撐。

關(guān)鍵詞:
  • 貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法  
  • 校準(zhǔn)  
  • 肽鏈  
作者:
崔健
單位:
中國石油大學(xué)勝利學(xué)院基礎(chǔ)科學(xué)學(xué)院; 山東東營257061
刊名:
中國石油大學(xué)勝利學(xué)院學(xué)報(bào)

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中國石油大學(xué)勝利學(xué)院學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:37-1446/TE。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1984年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。