摘要：目的利用生物信息學(xué)方法分析預(yù)測2型豬鏈球菌葡萄糖胺-6-磷酸脫氨酶(Glucosamine 6-phosphate deaminase,NagB)的性質(zhì)、結(jié)構(gòu)與功能等信息。方法利用DNAStar、ProtParam、PredictProtein、PSORT、SignalP、TMHMM、SOMPA、PROSITE、SWISS-MODEL、SYBYL-X和ClustalX等在線分析軟件對2型豬鏈球菌中的NagB理化性質(zhì)、亞細胞定位、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)及活性中心等進行分析。結(jié)果 NagB由378個氨基酸殘基構(gòu)成,無信號肽及跨膜區(qū),是穩(wěn)定的親水性胞漿蛋白。二級結(jié)構(gòu)以α螺旋和無規(guī)則卷曲為主分別占46.30%和32.28%,三級結(jié)構(gòu)模擬顯示其為典型的二聚體結(jié)構(gòu),單體的活性中心可能由Ala52、Ser55、Arg106、Ser107、Ser110、Phe164、Met166、Glu242、Val364、Asn365、Arg366、Val367、Val368等多個核心氨基酸構(gòu)成。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測NagB含有2個SIS功能結(jié)構(gòu)域(34-190aa;210-358aa),涉及磷酸糖的異構(gòu)酶功能,NagB的特征信息為進一步研究其在S.suis 2生長增殖以及致病過程中可能發(fā)揮的作用奠定了基礎(chǔ)。