摘要:綜合考慮主基因效應(yīng)以及基因間的交互效應(yīng)對(duì)植物選育種的作用是基因組選擇研究關(guān)注的熱點(diǎn)問題之一.目前已有的研究大多忽略了基因的交互效應(yīng),這主要是由于考慮交互效應(yīng)會(huì)大大增加備選基因的數(shù)目,從而導(dǎo)致已有的統(tǒng)計(jì)建模方法不穩(wěn)定.本文將基因效應(yīng)與基因間的交互效應(yīng)同時(shí)引入模型,提出三步模型構(gòu)建方法以達(dá)到簡化計(jì)算和提高模型預(yù)測精度的目標(biāo).第一步,不考慮具體模型,通過距離相關(guān)篩除方法刪掉與響應(yīng)變量顯著無關(guān)的基因;第二步,在剩下的基因中,利用貝葉斯方法篩選可能的基因;第三步,基于選出的基因,同時(shí)考慮單基因效應(yīng)和交互效應(yīng),利用懲罰方法選擇模型并估計(jì)參數(shù).通過模擬計(jì)算說明我們提出的方法與已有的一步模型選擇方法相比具有計(jì)算簡單、穩(wěn)健、運(yùn)行時(shí)間少并且預(yù)測精度高等優(yōu)點(diǎn).最后,將本文的方法應(yīng)用于油菜花數(shù)據(jù),實(shí)證分析表明,我們提出的方法顯著地提高花期性狀的預(yù)測精度.
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