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雨生紅球藻UVR8的基因克隆和生物信息學分析

摘要:【目的】獲得雨生紅球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全長,并進行生物信息分析?!痉椒ā恳杂晟t球藻為研究對象,通過同源克隆方法獲得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全長,并通過生物信息手段對其理化性質(zhì)、蛋白結構及系統(tǒng)進化進行分析。【結果】序列分析表明,HaeUVR8的編碼區(qū)全長為1554 bp,共編碼517個氨基酸,預測理論等電點為5.56,理論分子量為54.31 kD。通過BLASTp分析,與擬南芥中UVR8的相似性達到51%,與萊菌衣藻中UVR8的相似性達到59%。通過蛋白保守結構域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型結構域,包括7個葉片螺旋結構和保守的色氨酸殘基。系統(tǒng)進化分析表明,高等植物和真核綠藻來源UVR8s有共同祖先?!窘Y論】本研究首次獲得雨生紅球藻中編碼UVR8的基因序列,發(fā)現(xiàn)其結構與高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用機制,為雨生紅球藻中UVR8的表達、功能研究奠定基礎,同時為解析雨生紅球藻適應紫外光的分子機制提供線索。

關鍵詞:
  • 紫外抗性蛋白  
  • cdna全長  
  • 結構域  
  • 系統(tǒng)進化  
  • 雨生紅球藻  
作者:
張宏江; 抗偉; 馬浩天; 王曉丹; 李潤植; 崔紅利
單位:
山西農(nóng)業(yè)大學分子農(nóng)業(yè)與生物能源研究所; 山西太谷030801
刊名:
西南農(nóng)業(yè)學報

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西南農(nóng)業(yè)學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:51-1213/S。堅持指導性與實用性相結合的原則,創(chuàng)辦于1982年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。