摘要:生長(zhǎng)素反應(yīng)因子(AuxinResponseFactors,ARFs)是植物特有的多基因轉(zhuǎn)錄因子家族,參與植物生長(zhǎng)發(fā)育過程的調(diào)節(jié)。本研究基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學(xué)方法鑒定劍麻ARF基因家族成員,同時(shí)對(duì)其進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:在劍麻中共鑒定得到15個(gè)ARF基因,并依次命名為AhARF1~15。其編碼的蛋白質(zhì)含有409~1011個(gè)氨基酸,分子量約為45.17~112.13ku,等電點(diǎn)為5.17~9.34。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,13個(gè)AhARFs定位于細(xì)胞核,2個(gè)AhARFs定位于葉綠體。保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果表明,AhARFs基因家族有8個(gè)成員同時(shí)含有B3、ARF和Aux/IAA這3個(gè)相對(duì)保守的結(jié)構(gòu)域,其他成員僅含有B3和ARF這2個(gè)結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化樹分析表明,劍麻AhARFs蛋白可分為5個(gè)亞家族。15個(gè)劍麻AhARFs基因在劍麻紫色卷葉病不同發(fā)病時(shí)期呈現(xiàn)不同的表達(dá)規(guī)律。本研究為進(jìn)一步深入探索劍麻ARF基因家族的功能奠定了重要理論基礎(chǔ)。
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