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棗食芽象甲線粒體基因組全序列測定與系統(tǒng)發(fā)育分析

摘要:【目的】從線粒體基因組水平上探討棗食芽象甲Scythropus yasumatsui與近緣種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系?!痉椒ā坷肐llumina MiSeq測序平臺對棗食芽象甲線粒體基因組進(jìn)行測序,對基因組序列進(jìn)行拼裝、注釋和特征分析;利用貝葉斯法和最大似然法構(gòu)建基于象甲科13個物種的線粒體基因組13個蛋白質(zhì)編碼基因核苷酸序列的系統(tǒng)發(fā)育樹?!窘Y(jié)果】結(jié)果表明,棗食芽象甲線粒體基因組全長為16472 bp(GenBank登錄號:MF807224),包含13個蛋白質(zhì)編碼基因、22個tRNA基因、2個rRNA基因和2個非編碼控制區(qū),37個基因的排列順序與祖先昆蟲的線粒體基因排列順序一致。13個蛋白質(zhì)編碼基因的起始密碼子為ATN,其中除了cob和nad1基因的完全終止密碼子為TAG外,其余11個基因的完全終止密碼子為TA(A)。22個tRNA基因中除了trnS1缺少DHU臂,反密碼子由GCT變?yōu)門CT外,其余均能形成典型的三葉草結(jié)構(gòu)?;?3個蛋白質(zhì)編碼基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果顯示,象甲科8個亞科系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系為:(((隱喙象亞科(Cryptorhynchinae)+(象蟲亞科(Curculioninae)+魔喙象亞科(Molytinae)))+長小蠹亞科(Platypodinae))+(粗喙象亞科(Entiminae)+Cyclominae亞科))+隱頦象亞科(Dryophthorinae)+小蠹亞科(Scolytinae))?!窘Y(jié)論】在13種象甲科昆蟲物種中,同屬于粗喙象亞科的棗食芽象甲與南美果樹象甲Naupactus xanthographus在系統(tǒng)發(fā)育樹中聚為同一分支,表明基于線粒體基因組全序列的分子系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果與傳統(tǒng)的形態(tài)分類結(jié)果是一致的。

關(guān)鍵詞:
  • 鞘翅目  
  • 象甲科  
  • 棗食芽象甲  
  • 近緣種  
  • 線粒體基因組  
  • 蛋白質(zhì)編碼基因  
  • 系統(tǒng)發(fā)育  
作者:
張鋒; 洪波; 王遠(yuǎn)征; 李英梅; 陳志杰
單位:
陜西省生物農(nóng)業(yè)研究所; 西安710043; 陜西省酶工程技術(shù)研究中心; 西安710043
刊名:
昆蟲學(xué)報

注:因版權(quán)方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

期刊名稱:昆蟲學(xué)報

昆蟲學(xué)報緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:11-1832/Q。堅持指導(dǎo)性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1950年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。