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miR-125a/125b基因家族進化分析及其在豬睪丸組織中的表達變化

摘要:采用生物學(xué)信息方法在miRBase中搜索動物miR-125a/125b基因家族序列,利用Ensembl數(shù)據(jù)庫信息確定miR-125a/125b在基因組中的位置,采用MEGA 5.0構(gòu)建miR-125a/125b家族的系統(tǒng)進化樹,并利用qRT-PCR檢測miR-125a和miR-125b在沙子嶺豬睪丸組織不同發(fā)育時期(D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表達變化。結(jié)果在miRBase數(shù)據(jù)庫檢索29個物種共58條miR-125家族序列,分布廣泛,且有高度的保守性,除一個位于內(nèi)含子區(qū),兩個位于外顯子區(qū),其余miR-125a/125b位于基因間隔區(qū),在進化過程中,同種物種的進化方向具有高度的一致性,進化速度也有所不同。qRT-PCR檢測結(jié)果顯示,miR-125a/125b在沙子嶺豬睪丸組織中不同發(fā)育時期的具有相同的趨勢,即出生后其表達水平緩慢升高,保育期開始降低,性成熟期又開始呈現(xiàn)升高趨勢,隨著體成熟表達量開始降低。本研究結(jié)果為進一步探明miR-125a/125b基因家族在豬睪丸組織中的功能及作用機制奠定基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:
  • 豬  
  • 進化  
  • 定量表達  
作者:
高虎; 冉茂良; 翁波; 彭馥芝; 羅薈; 陳斌
單位:
湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院; 長沙410128; 畜禽遺傳改良湖南省重點實驗室; 長沙410128
刊名:
經(jīng)濟動物學(xué)報

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經(jīng)濟動物學(xué)報緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:22-1258/S。堅持指導(dǎo)性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1979年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。