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病毒感染海洋球石藻Emiliania huxleyi的轉(zhuǎn)錄組分析

摘要:海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特異性裂解病毒E.huxleyi virus(EhVs)在調(diào)節(jié)海洋碳、硫循環(huán)及全球氣候變化中起著重要作用,也是開展真核生物病毒–宿主相互作用研究的良好模型系統(tǒng)之一。為了探究病毒感染條件下E.huxleyi基因表達水平的變化,以海洋球石藻E.huxley–BOF 92及其專一性裂解病毒EhV-99B1為研究對象,利用Illumina HiSeq 2000高通量測序技術(shù),分別對E.huxleyi病毒感染組(Exp)和非感染對照組(Con)6 h和45 h的藻細胞樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序分析。共得到32909條平均長度為1153 bp的基因。病毒感染6 h和45 h分別得到2617和5229個差異表達基因,其中共差異表達基因465個。隨機選取10條差異表達基因,采用qRT-PCR進行實驗驗證,結(jié)果證實轉(zhuǎn)錄組分析可靠。GO功能注釋和KEGG通路富集,發(fā)現(xiàn)大量基因與氧化應(yīng)激反應(yīng)、脂類代謝、碳水化合物代謝及信號轉(zhuǎn)導等代謝過程相關(guān),其中變化最顯著的是谷胱甘肽代謝途徑。從病毒感染球石藻轉(zhuǎn)錄組中篩選出部分與氧化應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的基因,其中9個基因顯著上調(diào),11個基因顯著下調(diào),表明宿主能夠通過體內(nèi)的氧化應(yīng)激反應(yīng)響應(yīng)病毒脅迫。

關(guān)鍵詞:
  • 海洋球石藻emiliania  
  • huxleyi  
  • 病毒感染  
  • 轉(zhuǎn)錄組  
  • 差異表達基因  
  • 氧化應(yīng)激反應(yīng)  
作者:
田雪; 蔡偉聰; 蘇金凈; 吳書燕; 劉靜雯
單位:
集美大學食品與生物工程學院; 福建廈門361021; 福建省食品微生物與酶工程重點實驗室; 福建廈門361021
刊名:
海洋學報

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期刊名稱:海洋學報

海洋學報緊跟學術(shù)前沿,緊貼讀者,國內(nèi)刊號為:11-2055/P。堅持指導性與實用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1979年,雜志在全國同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。