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利福平和甲基磺酸甲酯對(duì)感染植原體毛泡桐中長(zhǎng)鏈非編碼RNA變化的影響

摘要:為研究與泡桐叢枝病相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(lncRNAs),以毛泡桐(Paulownia tomentosa)的健康苗、患叢枝病的病苗及分別用100 mg·L^-1的利福平和60 mg·L^-1甲基磺酸甲酯處理病苗得到的處理苗為試驗(yàn)材料,利用高通量測(cè)序技術(shù)研究病健苗及試劑處理苗中的lncRNAs及相應(yīng)靶基因的表達(dá)情況。共鑒定出3 700個(gè)lncRNAs,2 219個(gè)靶基因,從中得到389個(gè)差異表達(dá)的lncRNAs和對(duì)應(yīng)的203個(gè)靶基因,并對(duì)其靶基因進(jìn)行了GO功能分類。通過(guò)方案設(shè)計(jì)鑒定得到3個(gè)與泡桐叢枝病相關(guān)的lncRNAs,預(yù)測(cè)其對(duì)應(yīng)的靶基因分別為磷脂酶D、蛋白磷酸酶以及WNK賴氨酸缺乏蛋白激酶。采用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)驗(yàn)證隨機(jī)挑選的5個(gè)lncRNAs及其靶基因,驗(yàn)證結(jié)果與高通量測(cè)序結(jié)果一致。

關(guān)鍵詞:
  • 毛泡桐  
  • 叢枝病  
  • 長(zhǎng)鏈非編碼rna  
  • 利福平  
  • 甲基磺酸甲酯  
作者:
李小凡; 曹喜兵; 趙振利; 王哲; 趙曉改; 鄧敏捷; 范國(guó)強(qiáng)
單位:
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)泡桐研究所; 河南鄭州450002
刊名:
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)

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河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:41-1112/S。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1960年,雜志在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。