摘要：為了發(fā)掘茄子萼片刺形成的相關(guān)基因,為茄子萼片刺形成的機(jī)理和基因定位奠定基礎(chǔ),以萼片有刺和萼片無(wú)刺的2個(gè)自交系1607和1608為材料,構(gòu)建了F2遺傳分離群體,利用新一代高通量測(cè)序手段對(duì)雙親和2個(gè)混池的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)序分析。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析,共獲得409363358個(gè)干凈的高通量序列,其中比對(duì)到參考基因組的序列共有311756616個(gè),比對(duì)效率均大于75.00%。發(fā)掘24310個(gè)新基因,其中獲得注釋信息的新基因總數(shù)為1540個(gè)。對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的全部基因表達(dá)量進(jìn)行了分析,在雙親中共得到2438個(gè)差異表達(dá)基因,其中97個(gè)差異基因在2個(gè)混池中同時(shí)存在。通過(guò)對(duì)差異基因的注釋分析,富集到了可能與茄子萼片刺形成的相關(guān)的候選基因3個(gè):SmCKX(Eggplant_newGene_1802)、SmSTS(Sme2.5_09750.1_g00002)和SmFAR(Eggplant_newGene_4241)。SmCKX是一個(gè)茄子細(xì)胞分裂素氧化酶/脫氫酶相關(guān)基因,與番茄的Solyc04g080820.2和Solyc04g080810.3,擬南芥的AtCKX6具有同源性。SmSTS是茄子水蘇糖合成酶相關(guān)的基因,與番茄的Solyc01g079300.3基因和擬南芥的AT4G01970.1基因同源性較高。SmFAR是一個(gè)脂肪酰輔酶A還原酶相關(guān)基因,與番茄Solyc11g067180.2基因(FARx相關(guān)基因)同源。以上同源基因參與了植物角質(zhì),小檗堿和蠟生物合成途徑、細(xì)胞分裂素合成途徑和水蘇糖代謝途徑,因此,茄子萼片刺的形成可能具有相同的代謝調(diào)控途徑。