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2008-2018年遼寧省腸道病毒71型流行特征與VP1區(qū)基因特征分析

摘要:目的了解遼寧省的腸道病毒71型的流行特征并對(duì)VP1區(qū)基因特征進(jìn)行分析。方法用2008—2018年遼寧省14個(gè)市送檢的手足口病患者的陽(yáng)性標(biāo)本,通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)法分離腸道病毒,提取病毒RNA,用RT-PCR法對(duì)腸道病毒VP1區(qū)基因擴(kuò)增和序列測(cè)定。利用BLAST對(duì)測(cè)序結(jié)果比對(duì)后確定病毒基因型別。對(duì)鑒定為EV71的分離株進(jìn)行VP1區(qū)同源性分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果遼寧省在2008—2018年間實(shí)驗(yàn)室總計(jì)收到陽(yáng)性標(biāo)本24749份,其中最多的是其它腸道病毒(43.77%);其次是CA16(32.67%);EV71(23.2%)。隨機(jī)原則選取66株EV71毒株,核苷酸同源性為94.80%~99.80%,氨基酸的同源性為98.50%~100.00%;與C4a參考株的同源性最高,核苷酸的同源性為94.00%~98.00%,氨基酸的同源性為98.50%~100.00%;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,遼寧省EV71分離株為C4a基因亞型。結(jié)論EV71是引起遼寧省手足口病的重要病原體,是引起重癥及死亡病例的優(yōu)勢(shì)病原;EV71分離株為C4a基因亞型,并且在遼寧省內(nèi)有多個(gè)傳播鏈共同流行。

關(guān)鍵詞:
  • 手足口病  
  • 腸道病毒71型  
  • 基因特征  
作者:
于偉; 王伶; 雷露; 張倩; 毛玲玲; 姚文清; 楊佐森
單位:
遼寧省疾病預(yù)防控制中心; 沈陽(yáng)110005
刊名:
公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)

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