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成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析

摘要:目的分析成都某部感染乙型流感病毒遺傳進(jìn)化與血凝素(HA)基因突變位點(diǎn)。方法通過(guò)犬腎上皮細(xì)胞(MDCK細(xì)胞)體外分離患者咽拭子標(biāo)本流感病毒毒株,用PCR獲取乙型流感病毒HA基因并測(cè)序,與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)在線比對(duì)并利用MEGA 6.06軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),分析突變位點(diǎn)。結(jié)果通過(guò)MDCK細(xì)胞接種,分離出1株乙型流感病毒株,以感染病例咽拭子核酸及分離毒株的核酸為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到1 755 bp全長(zhǎng)HA基因,獲得的序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),獲得基因登錄號(hào)為MH236281。通過(guò)在線比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建,該病例感染的病毒為Yamagata系乙型流感病毒。與乙型流感病毒Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88(GenBank No. M36105)相比,HA基因點(diǎn)突變堿基為57個(gè);與世界衛(wèi)生組織(WHO)推薦的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014 (Gen Bank No. KU592766)相比,突變堿基數(shù)為20個(gè)。進(jìn)一步對(duì)HA1氨基酸突變位點(diǎn)進(jìn)行分析,與四川地區(qū)往年流行株相比均發(fā)生了不同程度的突變,其中與2010年四川溫江的分離株(GenBank No. KP461138)相比突變位點(diǎn)較少,僅有4處點(diǎn)突變;與WHO推薦的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014相比,有2個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生了變異,分別為L(zhǎng)176Q和M255V,但突變沒(méi)有處于HA1上的抗原決定簇區(qū)域。其中176位點(diǎn)是一個(gè)全新的突變,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88及WHO推薦的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014的HA1 176位點(diǎn)均為亮氨酸(L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1 176位點(diǎn)突變?yōu)楣劝滨0?Q)。結(jié)論成都地區(qū)駐地部隊(duì)2017-2018流行季感染的乙型流感病毒HA基因已發(fā)生一些突變,但突變尚未造成抗原性的改變。

關(guān)鍵詞:
  • 流感病毒屬b型  
  • 血凝素  
  • 突變  
  • 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)  
作者:
劉媛; 王文博; 何怡蓓; 鄒自英; 朱紫衣; 熊杰
單位:
西部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院檢驗(yàn)科; 成都610083; 西部戰(zhàn)區(qū)疾病預(yù)防控制中心; 成都610021; 成都中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院; 成都610075
刊名:
第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)

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第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)緊跟學(xué)術(shù)前沿,緊貼讀者,國(guó)內(nèi)刊號(hào)為:31-1001/R。堅(jiān)持指導(dǎo)性與實(shí)用性相結(jié)合的原則,創(chuàng)辦于1980年,雜志在全國(guó)同類期刊中發(fā)行數(shù)量名列前茅。