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NetRD:一種利用Bing搜索結果補充文獻挖掘證據(jù)集的工具

摘要:目的當前生物文獻挖掘工作的重心是改進各挖掘模塊性能,以提升挖掘結果的可信度,但有很大比例的挖掘結果其文獻證據(jù)很少,為此本文提出一個利用Bing搜索引擎從海量Web數(shù)據(jù)中為文獻挖掘得到的生物實體關聯(lián)對提供補充證據(jù)的工具系統(tǒng)。方法利用現(xiàn)有文本挖掘技術從PubMed文獻中挖掘一批生物實體關聯(lián)對,引入BingWeb搜索模塊,以生物實體名作為關鍵詞從Web中利用Bing開放搜索API得到一批搜索結果,將這些結果整理成新的數(shù)據(jù)源,最終從該新的數(shù)據(jù)源中挖掘得到一批來自Web的補充證據(jù)。結果本系統(tǒng)(bioinfo.ustc.edu.cn/NetRD)對文獻證據(jù)較少的生物實體關聯(lián)對提供了有效的補充證據(jù)支持,豐富了文獻挖掘結果最終的證據(jù)集。結論以Web數(shù)據(jù)作為補充數(shù)據(jù)源,能夠有效地為文獻證據(jù)很少的生物實體對提供證據(jù)補充,為相關研究者確認兩個生物實體之間的關聯(lián)提供重要參考。

關鍵詞:
  • 生物文獻挖掘  
  • bingwebsearchapi  
  • 證據(jù)集  
  • 生物實體關聯(lián)對  
  • 證據(jù)補充  
作者:
鄒熊峰; 鄭浩然
單位:
中國科學技術大學計算機科學與技術學院; 合肥230027
刊名:
北京生物醫(yī)學工程

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