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基于SSR和SRAP標(biāo)記的紅花玉蘭品種遺傳關(guān)系分析及分子鑒定

摘要:【目的】為了解析紅花玉蘭各品種間的遺傳多樣性和遺傳差異等問題,本研究采用SSR和SRAP分子標(biāo)記方法對紅花玉蘭不同品種的遺傳多樣性水平和遺傳分化程度進(jìn)行評估,以建立其分子標(biāo)記體系?!痉椒ā恳?5個紅花玉蘭品種為實驗材料,分別進(jìn)行SSR和SRAP標(biāo)記擴增,計算出SSR和SRAP分子標(biāo)記的各遺傳參數(shù)。利用NTSYS-pc2.1軟件計算各品種間的遺傳相似系數(shù)并用非加權(quán)法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析。通過R語言分析篩選出能夠完全區(qū)分紅花玉蘭品種的引物對組合?!窘Y(jié)果】經(jīng)篩選共獲得18對具有多態(tài)性且條帶清晰的SSR引物,分別以35個紅花玉蘭品種基因組DNA為模板,共擴增出DNA條帶128條,每對引物擴增條帶在2~15之間,平均每對引物擴增7.1條,平均帶型數(shù)為10.6,平均有效帶型數(shù)為5.4,平均分辨能力(D)為0.72;不同引物的多態(tài)性位點百分比變化范圍很大,在0.142 9~1.000 0之間,均值為0.730 2;Shannon’s指數(shù)平均為0.304 2,范圍是0.086 4~0.433 7;平均期望雜合度為0.248 8,范圍是0.059 2~0.282 3。利用篩選獲得的11對SRAP引物對35個紅花玉蘭品種進(jìn)行鑒定,共擴增156條DNA條帶,引物擴增條帶數(shù)在7~18之間,平均每對引物擴增14.2條,平均帶型數(shù)為22.7,平均有效帶型數(shù)為13.2,平均分辨能力(D)為0.93;11對引物的多態(tài)性位點百分比平均數(shù)為0.815 6,變異范圍是0.657 1~1.000 0;平均Shannon’s指數(shù)為0.375 9,變異區(qū)間在0.287 2~0.455 3;平均期望雜合度為0.240 4,范圍在0.180 2~0.311 6之間?!窘Y(jié)論】紅花玉蘭具有較高的遺傳多樣性,經(jīng)篩選和優(yōu)化后的SSR和SRAP引物組合均能將現(xiàn)有紅花玉蘭品種完全區(qū)分開,實現(xiàn)了對紅花玉蘭品種的簡便、快速、準(zhǔn)確地鑒定,并為紅花玉蘭的保護(hù)和繁育,以及新品種的選育提供了重要的參考。

關(guān)鍵詞:
  • 紅花玉蘭  
  • 遺傳多樣性  
  • 品種鑒定  
  • ssr分子標(biāo)記  
  • srap分子標(biāo)記  
作者:
張妹; 何正權(quán); 馬江; 桑子陽; 朱仲龍; 張德春; 馬履一; 陳發(fā)菊
單位:
三峽區(qū)域植物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室(三峽大學(xué)); 湖北省三峽特色植物繁育工程技術(shù)研究中心; 三峽大學(xué)生物技術(shù)研究中心; 湖北宜昌443000; 北京林業(yè)大學(xué)省部共建森林培育與保護(hù)教育部重點實驗室; 北京100083; 湖北五峰土家族自治縣林業(yè)科學(xué)研究所; 湖北五峰443413; 五峰博翎紅花玉蘭科技發(fā)展有限公司; 湖北宜昌443400
刊名:
北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報

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